We Do Care Programme merupakan program unggulan yang melibatkan siswa kelas VII dalam melakukan aktivitas di lembaga sosial untuk mengembangkan karakter yang sesuai budaya sekolah yaitu Grateful, Acceptance, dan Caring and Sharing. 

Shafr Camp merupakan kependekan dari Shaf (Barisan) Hijrah Camp. Shafr Camp adalah program Latihan Dasar Kepemimpinan Siswa di SMP Mutiara Bunda. Di sini murid dididik untuk dapat disiplin, menghargai waktu, mengikuti peraturan dan bagaimana bekerjasa sama dalam kelompok agar selalu kompak dan peduli satu sama lain. Program ini bertujuan untuk menanamkan serta menginternalisasikan Mutbun Values, menumbuhkan semangat ukhuwah dan mengasah kemampuan berorganisasi

Professional Youth Programme merupakan kegiatan yang melibatkan siswa kelas VIII untuk berkegiatan di lembaga profit. Program ini bertujuan untuk mengembangkan karakter yang sesuai dengan budaya sekolah yaitu Grateful, Continuous Improvement, dan Persistence.

SAMBA (Students’ Association of Mutiara Bunda)  adalah organisasi siswa intra SMP Mutiara Bunda. Melalui organisasi ini siswa dilatih untuk meningkatkan kemampuan berorganisasi, menyusun program, melaksanakan program, dan mempertanggungjawabkannya.

Musyawarah Perwakilan Kelas (MPK) adalah badan musyawarah siswa yang mewadahi aspirasi siswa. Setiap kelas akan memiliki satu atau lebih wakil siswa yang duduk di MPK, dan perwakilan siswa ini merupakan hasil musyawarah siswa dalam kelas. Selain menjadi wadah aspirasi seluruh warga sekolah, MPK juga menjadi mitra bagi SAMBA dalam melaksanakan program yang telah disusun.

Program untuk siswa level IX yang bertujuan agar siswa mampu menyusun rancangan masa depan selama sepuluh tahun setelah lulus dari SMP Mutiara Bunda. Program ini sejalan dengan nilai nilai sekolah yaitu Continuous Improvement dan Persistence.

Kegiatan pembelajaran integrasi mata pelajaran yang bertujuan untuk mengamati dan mempelajari langsung objek, tempat, atau fenomena tertentu di lokasi di luar lingkungan sekolah atau tempat biasa kegiatan belajar mengajar. Kegiatan ini bertujuan untuk melengkapi dan memperkaya proses pembelajaran dengan memberikan pengalaman nyata kepada siswa.

Merupakan kegiatan ekshibisi pembelajaran yang melibatkan seluruh siswa dan guru untuk menampilkan hasil karya bisnis serta teknologi. Diantara tujuannya kegiatan ini untuk memfasilitasi dan mengembangkan kemampuan entrepreneur dan technopreneur siswa sejalan dengan perkembangan zaman di keterbukaan informasi dan teknologi.

Pameran berbagai macam karya seni dan kerajinan tangan yang dibuat oleh siswa pada mata pelajaran Seni Budaya dan Prakarya. Kegiatan ini juga untuk menampilkan kreativitas, mendukung bakat seni siswa, dan menyediakan etalase bagi siswa untuk memamerkan dan mengenalkan kreasi mereka ke lebih luas.

Program pembangunan karakter sesuai tumbuh kembang anak usia 12-15 tahun (kelas 7 sampai dengan kelas 9) berbasis pendidikan fitrah dan aqil baligh.

Pembiasaan di setiap pagi hari untuk mengawali pembelajaran berupa kegiatan shalat dhuha, zikir pagi dan asmau husna, serta tausiah

Program menghafal ayat-ayat suci Al-Qur’an yang wajib diikuti oleh seluruh siswa

Program pengembangan Pendidikan Agama Islam untuk seluruh murid yang dirancang sesuai dengan kisah perjalanan hidup Rasulullah Nabi Muhammad Shalallahu ‘alaihi wa Sallam. Melalui program ini diharapkan siswa dapat meneladani sikap dan perilaku Nabi Muhammad Shalallahu ‘alaihi wa Sallam dan menjadikan idola dalam kehidupan.

Pembelajaran muatan lokal khas dan unggulan SMP Mutiara Bunda untuk meningkatkan kemampuan tilawah dan tahsin Al-Qur’an siswa. Selain itu, juga dibahas mengenai tafsir tematik ayat Al-Qur’an dan mahfudzot bahasa Arab.

Kegiatan untuk memperingati dan merefleksi dari hari-hari besar umat Islam yang dikemas dengan beragam aktivitas, seperti kajuan dan kompetisi

Berupa penanaman dan pembiasaan adab dan akhlak seluruh warga sekolah berdasarkan ajaran dan nilai-nilai Islam

Program spesial dalam rangka menghidupkan bulan suci Ramadhan dengan kegiatan-kegiatan pengembangan diri dan partisipasi sosial. Beberapa kegaitan yang dilaksanakan yaitu kajian Islam, mabit, tadabbur Qur’an, murajaah hafalan Qur’an dan Hadis, bakti sosial, dan lain-lain.

One Day Market merupakan annual event yang diadakan setiap tahun dengan tema yang berbeda-beda. Program ini bertujuan untuk mengembangkan kemampuan siswa secara berkelanjutan. Seluruh siswa dari level 7, 8, dan 9 ikut berpartisipasi dengan peran yang berbeda bagi masing-masing tingkat kelas. Untuk level 7 berperan sebagai Entrepeneur, kelas 8 berperan sebagai Event Organizer, dan level 9 berperan sebagai Entertainment.

Program ini bertujuan untuk memperkenalkan siswa kepada dunia global dan segala perbedaan baik bahasa maupun budayanya. SMA Mutiara Bunda telah menjalin kerja sama dengan berbagai lembaga pertukaran pelajar. Siswa yang berminat dapat mengikuti program belajar ke luar negeri melalui berbagai program (short term maupun long term).

Kegiatan yang melibatkan siswa dari berbagai negara ini dilakukan rutin setahun sekali. Selain itu, bagi siswa yang berencana melanjutkan studi di luar negeri, dapat mengikuti long term student activities bersama mitra kami dalam rangka membantu proses seleksinya. SMA Mutiara Bunda pun menerima kunjungan dari siswa luar negeri yang akan belajar bersama siswa Mutiara Bunda selama mereka berada di Indonesia.